Los destinatarios de la acción del CEP son, por una parte, ocho entidades de cooperación:

1. Desarrollo y Paz, Canadá
2. Diakonie - Apoyo en Emergencias, Alemania
3. EED (Servicio de las Iglesias Evangélicas en Alemania para el Desarrollo)
4. ESP - Becas Ecuménicas, Alemania
5. Fundación Rosa Luxemburg, Alemania
6. HIVOS, Holanda
7. ICCO, Holanda
8. Pan para el Mundo, Alemania

Y, por otra, aproximadamente 200 organizaciones sociales ecuatorianas y organizaciones no gubernamentales.

Lleva la gestión de un proyecto especial: Fondo Ágil, que cuenta con el apoyo de Pan para el Mundo (Alemania) e ICCO (Holanda). Para el funcionamiento del Fondo Ágil el CEP promocionó la conformación de la ONG ecuatoriana COFA - Corporación Fondo Ágil, y actúa como Secretaría Técnica de dicho fondo, cuyos apoyos se dirigen a grupos sociales organizados y necesitados que pueden recibir financiamientos para sus planes de trabajo (ver información disponible en esta página web).